Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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