Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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R3HDM1Q15032 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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R3HDM1Q15032 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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R3HDM1Q15032 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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R3HDM1Q15032 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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R3HDM1Q15032 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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