Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAPVD1Q14C86 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAPVD1Q14C86 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
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