Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHPRHQ149N8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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