Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHD4Q14839 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHD4Q14839 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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