Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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