Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRCAPQ14761 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms