Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAPSNQ13702 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms