Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HDAC1Q13547 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HDAC1Q13547 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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