Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 HSPA8P3-201ENST00000449300 780 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC245519.2-201ENST00000633673 475 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SLC8A1-AS1-204ENST00000427354 790 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AP000534.1-201ENST00000444162 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MKRN4PQ13434 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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