Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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SRSF5Q13243 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRSF5Q13243 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRSF5Q13243 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SRSF5Q13243 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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SRSF5Q13243 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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