Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K1Q13233 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP3K1Q13233 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms