Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMARCB1Q12824 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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