Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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EFEMP1Q12805 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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EFEMP1Q12805 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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EFEMP1Q12805 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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EFEMP1Q12805 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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EFEMP1Q12805 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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EFEMP1Q12805 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFEMP1Q12805 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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