Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PAX8Q06710 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms