Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POU5F1Q01860 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms