Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
IFITM3Q01628 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
IFITM3Q01628 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms