Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDC42EP1Q00587 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 416.2 ms