Protein–RNA interactions for Protein: P63128

ERVK-9, Endogenous retrovirus group K member 9 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-9P63128 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK-9P63128 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms