Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ERVS71-1P61550 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms