Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OXCT1P55809 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms