Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
EFNA4P52798 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms