Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP4P49662 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms