Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LHX1P48742 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX1P48742 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHX1P48742 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHX1P48742 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHX1P48742 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHX1P48742 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHX1P48742 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHX1P48742 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHX1P48742 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHX1P48742 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHX1P48742 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX1P48742 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms