Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GCLCP48506 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCLCP48506 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCLCP48506 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCLCP48506 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCLCP48506 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCLCP48506 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCLCP48506 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCLCP48506 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCLCP48506 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCLCP48506 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCLCP48506 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCLCP48506 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCLCP48506 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCLCP48506 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLCP48506 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLCP48506 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLCP48506 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLCP48506 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLCP48506 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLCP48506 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLCP48506 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLCP48506 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLCP48506 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLCP48506 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLCP48506 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLCP48506 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLCP48506 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCLCP48506 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms