Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRB2P47870 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GABRB2P47870 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms