Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACADSBP45954 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACADSBP45954 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms