Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CHRNA4P43681 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA4P43681 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms