Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIA2P42262 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms