Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIK1P39086 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms