Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FDFT1P37268 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms