Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSP1P33241 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSP1P33241 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSP1P33241 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSP1P33241 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSP1P33241 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LSP1P33241 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LSP1P33241 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms