Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALDH4A1P30038 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms