Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT1P26358 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms