Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKCHP24723 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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