Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATP5F1P24539 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATP5F1P24539 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATP5F1P24539 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms