Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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