Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC9A1P19634 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC9A1P19634 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC9A1P19634 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC9A1P19634 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC9A1P19634 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms