Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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PTPRAP18433 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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PTPRAP18433 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
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PTPRAP18433 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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PTPRAP18433 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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PTPRAP18433 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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