Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BMP3P12645 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BMP3P12645 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BMP3P12645 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms