Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
DMDP11532 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
DMDP11532 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
DMDP11532 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DMDP11532 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DMDP11532 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DMDP11532 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
DMDP11532 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
DMDP11532 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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