Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA4P06727 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA4P06727 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA4P06727 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms