Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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