Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB6O95452 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB6O95452 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms