Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCNDBP1O95273 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCNDBP1O95273 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms