Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LRATO95237 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LRATO95237 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRATO95237 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms