Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NBNO60934 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NBNO60934 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NBNO60934 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NBNO60934 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NBNO60934 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NBNO60934 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NBNO60934 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms