Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCC9O60706 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCC9O60706 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms