Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR5O60602 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR5O60602 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR5O60602 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR5O60602 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR5O60602 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR5O60602 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TLR5O60602 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TLR5O60602 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TLR5O60602 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TLR5O60602 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms