Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CREB3O43889 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CREB3O43889 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CREB3O43889 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms